本实用新型提供了一种自动闸门控制器和太阳能渠道闸门自动控制系统，属于自动化控制技术领域。所述自动闸门控制器包括：主控模块、闸门开度控制指令获取模块、闸门开度检测模块和PWM脉宽调制模块；主控模块，分别与闸门开度控制指令获取模块、闸门开度检测模块和PWM脉宽调制模块相连。所述太阳能渠道闸门自动控制系统包括：太阳能电池板、蓄电池、电压转换模块、主控模块、闸门开度控制指令获取模块、闸门开度检测模块和PWM脉宽调制模块；太阳能电池板，与蓄电池相连；蓄电池，分别与太阳能电池板和电压转换模块相连；主控模块，分别与电压转换模块、闸门开度控制指令获取模块、闸门开度检测模块和PWM脉宽调制模块相连。